Des navires font naufrage sous les coups d'une créature mystérieuse. La Marine américaine expédie une frégate. A son bord, le célèbre professeur Aronnax, chargé de débarrasser les océans de ce monstre. Mais alors que la fameuse rencontre a lieu, le professeur est loin de se douter qu'un fabuleux voyage sous-marin l'attend.