Pour Tasuku Arisawa, la vie tourne autour du club de kendo, dans lequel il est très engagé, et de son petit frère Tsubasa, la seule famille qu'il lui reste depuis la mort de leurs parents. Un jour, un mystérieux homme vêtu de noir l'attaque, et le lycéen se retrouve projeté dans le monde parallèle de Ni no Kuni ! Les habitants de ce royaume enchanteur - où la magie est omniprésente - semblent voir en Tasuku un sauveur destiné à triompher du belliqueux seigneur Sham et de sa horde de démons... Mais quels secrets se cachent réellement à Ni no Kuni ?