Quatre ans après l'incident de la fosse des Mariannes qui a vu l'apparition d'un mégalodon, la progéniture de la créature est désormais hébergée par le paléontologue Jonas Taylor à l'institut Tanaka. Criblé de dettes, Masao Tanaka, le dirigeant de l'institut, est obligé de se tourner vers un milliardaire excentrique pour sauver son établissement, mais le prix à payer est lourd.