Le récit de l'histoire des travaux met en évidence la prouesse architecturale qu'a constituée la construction du Musée des confluences. La genèse du projet est évoquée, illustrée de croquis, de plans et de clichés de maquettes. Les étapes du chantier sont reconstituées, ponctuées de clichés des matériaux. La place du Musée dans la ville de Lyon est également abordée.